Le système éducatif du Soudan du sud se caractérise par un faible investissement, de faibles capacités, mais une forte demande cependant.
Les efforts des plans nationaux en faveur de la consolidation de l'État et de la paix, poussent le système éducatif à se développer rapidement, à réduire les inégalités et à fournir un enseignement approprié. Mais, les dépenses publiques pour l’éducation ici sont parmi les plus faibles au monde.
Les bases de l’administration et de la gestion du secteur sont rudimentaires, ce qui n’a commencé à se développer avec le reste de la fonction publique du pays qu’après l’Accord de paix de 2005. Mais, les efforts du gouvernement en matière de renforcement des capacités ont été interrompus par le conflit.
Le Plan sectoriel de l'éducation générale (PSEG) 2017-2022, intitulé « Planifier pour la sécurité, la résilience et la cohésion sociale », vise à contenir cette contrainte sur le système et à donner au secteur une orientation vers la stabilité basée sur des données, des dépenses de financement.
Les deux premières années du PSEG sont conçues comme un plan de transition qui devrait augmenter rapidement le nombre d'inscriptions, ainsi que la construction de nouvelles infrastructures, la fourniture de matériel d'enseignement et d'apprentissage de base, la régularisation du salaire des enseignants et la formation des enseignants pour faire face à l'augmentation du nombre d'inscriptions.
Les trois années suivant le PSEG sont consacrées à l'institutionnalisation de la formation des enseignants, à la supervision des écoles et au développement de l'enseignement secondaire et technique.
Le système éducatif du pays comprend 8 000 écoles primaires (niveaux 1 à 8), 120 établissements d'enseignement secondaire (niveaux 9 à 12) et une université. Il n’existe dans le pays qu’un seul établissement de formation d’enseignants fonctionnel pour répondre à la demande de formation des enseignants.